Nanoscale Biophysics & Biomedicine Laboratory

West China Medical Center, Sichuan University

张明 Ming ZHANG

通讯地址：四川省成都市武侯区人民南路三段17号 四川大学华西校区
邮箱：z.mysteryAToutlook.com

教育经历
2024年9月 – 2028年6月(预期) 四川大学 | 博士生，生物与医药
2022年9月 – 2023年9月 苏黎世联邦理工学院 | 博士生，生物系统科学与工程
2019年9月 – 2022年6月 四川大学 | 硕士，药学
2015年9月 – 2019年6月 四川大学 | 学士，生物技术

研究与工作经历
四川大学 | 博士生 2024年9月 – 至今
• 在耿佳教授-单分子生物传感研究组进行博士课程学习和科学研究。研究方向为单分子多肽测序技术的开发与应用
• 获得2024年度国家自然科学基金青年学生基础项目研究（博士生研究生）资助（全国每年仅约300名博士生获此资助）

孔确（成都）科技有限公司 | 实习研究员 2023年11月至2024年8月
• 协助基因测序仪、电生理工作站等科研仪器的开发与应用验证
• 负责客户端反馈需求的对接与解决方案制定

苏黎世联邦理工学院/巴塞尔大学 | 博士生研究助理 2022年9月至2023年9月
• 研究方向为蛋白质药物的理性改造
• 在巴塞尔大学化学系担任分析化学实验课助教，独立辅导12位本科生完成实验及报告撰写，及实验室日常管理

四川大学 | 本硕 2017年9月至2022年6月
• 硕士期间，在耿佳、陈路教授指导下发起、执行并验证了一项概念验证研究，该研究利用纳米孔技术实现了二十种蛋白质氨基酸的直接单分子识别，及多肽的实时测序
• 参与了新冠疫情初期四川省SARS-CoV-2基因组监测的科研工作；在两次地方疫情爆发期间，与四川省和市卫生部门合作，开展了感染患者的临床研究，对病毒基因组进行测序和分析，为制定优化的疾病控制和预防策略提供决策依据
• 本科期间，在耿佳教授的指导下，开发了一种功能化纳米孔，用于实时感知单个活细胞内的神经递质

科研项目
国家自然科学基金青年学生基础研究项目(博士研究生) 批准号: T24B2010
项目名称: 基于纳米孔-多肽外切酶复合物的单分子多肽传感测序研究
负责人: 张　明
资助经费: 30万元 起止年月: 2025年01月- 2027年 12月

论文著述

  1. Zhang M#, Tang C#, Wang Z#, Chen S#, Zhang D, Li K, Sun K, Wang Y, Zhao C, Xu M, Dai L, Lu G, Shi H, Chen L, Geng J. Real-time detection of 20 amino acids and discrimination of pathologically relevant peptides with functionalized nanopore. 2024. Nature Methods 21, 609-618（封面论文，ESI高被引）
  2. Zhang X#, Dou L#, Zhang M#, Wang Y, Jiang X, Li X, Wei L, Chen Y, Zhou C, Geng J*. Real-time sensing of neurotransmitters by functionalized nanopores embedded in a single live cell. 2021. Molecular Biomedicine 2, 6
  3. Zhang M, Chen C, Zhang Y, Geng J*. Biological nanopores: engineering and applications (Review). 2022. Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics 1-14
  4. Zhao C#, Wang Y#, Chen C#, Zhu Y, Miao Z, Mou X, Yuan W, Zhang Z, Li K, Chen M, Liang W, Zhang M, Miao W, Dong Y, Deng D, Wu J, Ke B, Bao R, Geng J*. Direct and Continuous Monitoring of Multicomponent Antibiotic Gentamicin in Blood at Single-Molecule Resolution. 2024. ACS Nano 18, 12, 9137–9149
  5. Zhao C#, Chen M#, Liu X, Yuan W, Li K, Wang Y, Chen C, Zhang M, Dong Y, Xiao Y, Deng D, Geng J*. Direct single-molecule detection of CoA-SH and ATP by the membrane proteins TMEM120A and TMEM120B. 2024. Nanoscale 16, 6087-6094
  6. Zhao C#, Li K#, Mou X#, Zhu Y, Chen C, Zhang M, Wang Y, Zhou K, Sheng Y, Liu H, Bai Y, Li X, Zhou C, Deng D, Wu J, Wu H, Bao R, Geng J*. High-fidelity biosensing of dNTPs and nucleic acids by controllable subnanometer channel PaMscS 2022. Biosensors and Bioelectronics 200, 113894
  7. Li X#, Song G#, Dou L#, Yan S, Zhang M, Yuan W, Lai S, Jiang X, Li K, Sun K, Zhao C, Geng J*. Structure and unzipping behavior of dumbbell and hairpin DNA revealed by real-time nanopore sensing. 2021. Nanoscale 13, 11827-11835
  8. Lin J#, Tang C#, Wei H#, Du B#, Chen C#, Wang M#, Zhou Y, Yu M, Cheng L, Kuivanen S, Ogando NS, Levanov L, Zhao Y, Li C, Zhou R, Li Z, Zhang Y, Sun K, Wang C, Chen L, Xiao X, Zheng X, Chen S, Zhou Z, Yang R, Zhang D, Xu M, Song J, Wang D, Li Y, Lei S, Zeng W, Yang Q, He P, Zhang Y, Zhou L, Cao L, Luo F, Liu H, Wang L, Ye F, Zhang M, Li M, Fan W, Li X, Li K, Ke B, Xu J, Yang H, He S, Pan M, Yan Y, Zha Y, Jiang L, Yu C, Liu Y, Xu Z, Li Q, Jiang Y, Sun J, Hong W, Wei H, Lu G, Vapalahti O, Luo Y, Wei Y, Connor T, Tan W, Snijder EJ, Smura T, Li W, Geng J, Ying B, Chen L. Genomic monitoring of SARS-CoV-2 uncovers an Nsp1 deletion variant that modulates type I interferon response. 2021. Cell Host & Microbe 29, 489-502
  9. Chen P, Bai Y, Tang Y, Yan S, Wang X, Wei W, Wang J, Zhang M, Ying B, Geng J. Rapid and highly sensitive visual detection of oxalate for metabolic assessment of urolithiasis via selective recognition reaction of CdTe quantum dots. 2020. Journal of Materials Chemistry B 8, 7677-7684
  10. Sun K#, Zhao C#, Zeng X#, Chen Y#, Jiang X#, Ding X, Gou L, Xie H, Li X, Zhang X, Lin S, Dou L, Wei L, Niu H, Zhang M, Tian R, Sawyer E, Yuan Q, Huang Y, Chen P, Zhao C, Zhou C, Ying B, Shi B, Wei X, Jiang R, Zhang L, Lu G, Geng J*. Active DNA unwinding and transport by a membrane-adapted helicase nanopore. 2019. Nature Communications 10, 5083

专著

  1. Zhang P, Zhang M, Geng J*. Carbon-Based Nanomedicine. In: Xue X. (eds) Nanomedicine in Brain Diseases. Springer, Singapore (2019)

发明专利

  1. 耿佳; 张明; 王紫纯; 魏于全; 陈山川 ; 一种基于铜离子修饰MspA纳米孔的多肽成分分析方法, 2022, WIPO, PCT/CN2022/114670
  2. 陈山川; 刘伟; 张明; 王紫纯; 魏于全; 耿佳 ; 一种氨基酸检测方法, 2023, 中国, 202310412210.0

学术报告

  1. APS Global Physics Summit，2025，美国加州阿纳海姆（分会场口头报告）
  2. 中国材料大会智能医药材料与器件分会，2024，广州（分会场口头报告 / 优秀青年学术报告奖）
  3. Single-Molecule Protein Sequencing 3，2022， 荷兰代尔夫特 （主会场口头报告）
  4. Single-Molecule Sensors and NanoSystems International Conference，2020，西班牙（线上）